ЗАО «Центральный депозитарий»  предоставляет Депонентам — юридическим и физическим лицам услуги по хранению ценных бумаг (сертификатов ценных бумаг) и/или учету  прав на ценные бумаги, переходу прав на ценные бумаги, принадлежащие Депоненту на праве собственности или ином вещном праве, путем открытия и ведения Депозитарием счета депо Депонента и осуществления операций по этому счету на основании поручений Депонента или его уполномоченного представителя.

Иначе говоря в отношении ценных бумаг ЗАО «Центральный депозитарий»  осуществляет практически те  же функции,  что  и  банковская система в отношении денег,  за исключением права распоряжаться ими.

 ЗАО «Центральный депозитарий» создан в 1997 году, имеет лицензию профессионального участника рынка ценных бумаг на осуществление депозитарной деятельности по ценным бумагам № 127, выданную 20 апреля 1998 г. Национальной комиссией по рынку ценных бумаг при Президенте Кыргызской Республики.

Первыми клиентами «Центрального депозитария» стали зарубежные инвесторы, которые открыли счета-депо и перевели на них принадлежащие им ценные бумаги эмитентов-резидентов Кыргызской Республики. В течение 1998 года клиентами «Центрального депозитария» стали многие брокерские компании, работающие на Кыргызской Фондовой Бирже. В настоящее время в число клиентов ЗАО «Центральный Депозитарий»  входят ведущие брокерские Компании, работающие на фондовом рынке Кыргызской Республики, коммерческие банки, инвестиционные фонды, крупные зарубежные инвесторы.

Сегодня ЗАО «Центральный Депозитарий»  является  соучредителем и полноправным членом Ассоциации центральных депозитариев Евразии (АЦДЕ).

Деятельность Центрального Депозитария построена на самоокупаемости. В настоящее время согласно постановления Правительства Кыргызской Республики от 18 июля 2011 года №399 «О приобретении дополнительно выпускаемых акций закрытого акционерного общества «Кыргызская фондовая биржа» и закрытого акционерного общества «Центральный депозитарий» рассматривается возможность оказания государственной поддержки путем участия государства в капитале ЗАО «Центральный депозитарий», поскольку данная учетная структура является одной из фундаментальных структур на рынке ценных бумаг и играет большую роль в создании привлекательной среды для иностранных инвестиций и дальнейшего развития рыночных реформ в государстве.

Кроме того, Постановлением Правительства Кыргызской Республики от18 июля 2011года №399  решен один из основополагающих вопросов, касающийся  какова будет роль государства в ЗАО «Центральный депозитарий», финансировании его строительства. Данным постановлением Фонду по управлению госимущества поручается обеспечить приобретение государством  акций ЗАО «Центральный депозитарий» в размере 51%.

ЗАО «Центральный депозитарий»  ведет счета юридических и физических лиц – как резидентов, так и нерезидентов.

 Своим клиентам Депозитарий ЗАО «Центральный депозитарий»  предлагает полный спектр депозитарных услуг по всем видам ценных бумаг, обращающихся на кыргызском и международном рынках.

 Иностранный депозитарий-корреспондент на общих основаниях может открыть счет номинального держания в ЗАО «Центральный депозитарий». В ЗАО «Центральный депозитарий» с 2000 года открыт счет Центральному Депозитарию Республики Казахстан.

Любые ценные бумаги, обслуживаемые ЗАО «Центральный депозитарий», могут учитываться на счете депозитария-нерезидента

Стоимость клиентских активов, находящихся на хранении и учете  в ЗАО «Центральный депозитарий», за 2011 год  возросла на 224% и составила на конец года 400,34 млрд.сомов